莫蘭蒂颱風來襲期間造成高雄港嚴重災情，富冠606號及707號已經拖離，目前仍有順天606號和永興發168號2艘船隻擱淺，其中順天606號有漏油情形。
交通部17日表示，高雄港務公司和高雄市政府已經聯繫船東處理，預計3到7天完成船艙抽油和船體移除工作。交通部參事謝界田說：『(原音)在航港的部分，有富冠2條船已經拖離，順天部分有船艙漏油情形跟船體要移除，這部分3到7天內一定會完成，為了防止油污，高雄市政府已經全面協助船東處理當中。』
另外，在金門港擱淺的大陸籍貨船港泰州台號，目前沒有漏油、沉沒之虞，大陸方面已經派遣船隻前往拖救，航港局也邀集相關單位討論後續處置事宜。環保署表示，金門縣環保局17日也前往現勘，並發布攔油索和進行局部油污清理工作。
此外，莫蘭蒂颱風造成全國108萬3,900多戶停電，經過台電搶修已經修復99萬多戶，其中台南市停電戶數全部修復；台東縣因為公路未搶通，還有82戶未復電，其餘都已經修復；屏東縣林邊、佳冬和枋寮預計17日晚間10時也可恢復供電。在供水方面，高雄市70萬戶全部恢復供水；澎湖縣、台東縣和台中市也恢復供水；小琉球也恢復正常供水。