國家災害防救科技中心組長于宜強表示，根據各國路徑預測，莫蘭蒂將掠過台灣南端，14日到15日上午對台灣影響最為劇烈。他指出，13日下半天東部及南部就會開始有明顯雨勢，在颱風接近前，主要降雨區域為宜蘭、花蓮、台東、屏東，之後逐步擴及台南、高雄與澎湖，這些地區都要嚴防淹水。于宜強強調，颱風接近時，災情將集中在東部與南部；颱風遠離後，災情則會集中在南部地區。他說：『(原音)我們可以研判在颱風接近的時候，主要發生災害的區域大概可以分為花蓮、台東、屏東高雄跟台南附近，當颱風遠離之後，災害大概會在南部出現。』
于宜強指出，預測颱風侵襲台灣時最接近屏東縣，近中心風速可達17級；台東、屏東、高雄、台南、澎湖等縣市將遭受10級暴風圈影響，這些地區須嚴防路樹及招牌倒塌、掉落。此外，從13日下半天開始，東部與南部地區也會出現長浪，預估將有8到15公尺，沿海地區須嚴防海水倒灌及暴潮。
于宜強說，坡地災害風險較大地區為花蓮縣秀林鄉、萬榮鄉、台東縣金峰鄉、太麻里鄉及玉里鄉，以及屏東縣霧台鄉、滿洲鄉等地，針對易成孤島地區與危險聚落，應進行預防性疏散撤離與緊急避難安置規劃。災害風險較高的道路則包括中橫公路(台8線)、台9、台20、台23，各公路單位應預劃搶險機具並預先封橋、封路。此外，這次颱風影響期間適逢中秋節連續假期，科技中心也請交通單位掌握颱風動態、及早因應，研擬疏運計畫。