邱莉莉指出，中國當時為進行經濟統戰牽制陳水扁政府執政，有計劃推動養殖漁業契作，當時民進黨政府基於和中國契作有高度政經風險並未鼓勵，直到馬英九上任總統後，中國國台辦官員數次前來台南洽談虱目魚契作，部分漁民在資訊不充足情況下，被誘導投入有高風險性的契作，如今契作終止，居中牽線卻隱瞞詳情的特定團體應該負最大責任。
邱莉莉表示，虱目魚契作和當初所描繪遠景不同走向中止，主要是中國飲食對虱目魚接受度有限、寒害凍死魚苗、加上原先五年契作也已期滿，現在把契作問題導向民進黨執政、還演出燒黨證戲碼，很明顯就是政治操作，挑撥漁民對政府的仇恨。
邱莉莉強調，虱目魚契作收購價年年跌落，每台斤從45元掉到40元，還有魚販操控價格，都可見契作原本風險就不低，當年獲利空間是中國配合國民黨演出的利多行情，如今又重演「以經促政」的老套手法，居心著實可議。
邱莉莉強調，民進黨政府從沒阻撓民間契作，協助推廣農漁業產銷貿易工作並未停歇，漁業署的公文主要是約束「政治性內容」需經主管機關許可，目的仍在確保農漁民權益，而國民黨和特定團體把農漁民權益和生計當成政治工具操控相當不負責，應該停止政治算計與操弄。