蔡英文總統29日在總統府接見里約奧運代表團時致詞表示，政府應打造一個更好的體育環境，讓教練與選手沒有後顧之憂全力拚戰，因此將開始推動單項運動協會的改革工作；首先就是協會的組織，要讓更多人可以參與運作，總統說：『(原音)體育署跟內政部將會合作來改革協會的組織，讓它更開放、更專業、更具代表性，並且設置獨立公益理事，參與決策及監督的業務。』
其次是在公開、透明、專業原則下，建立教練與選手的遴選制度，制定稽核的標準作業流程，並建立外部獨立的仲裁小組，以保障選手權益，總統說：『(原音)如果選手及教練未來受到不公平待遇時，可以得到公正、迅速的仲裁機會，我們期待協會也必須遵守這些仲裁的決定，絕不能如外界所指的秋後算帳。』
總統提出的第3點改革工作是財務透明化，基本原則是公開、透明的財務管理機制，贊助商的合約問題也應參考國際範例，在維護選手權益的原則下建立規範機制。
第4點是落實績效考核客觀化，建立客觀的績效標準，所有的獎勵補助都要根據標準來執行，「沒有特殊關係，也不容許特別的關說」。
總統指示體育署與內政部儘速依照相關法令與辦法展開查核，並根據查核結果獎助績效協會；而運作不足的協會則要求改進，如果該協會依然不改進，政府在必要時會依法停止行政資源、經費補助。總統表示，凡有法源依據的工作現在就會展開，如果沒有的、也會修改國民體育法與訂定專法，這是政策的短、中、長期目標。