有關蘭嶼自治議題，總統表示，「部落公法人組織設置辦法」即將在9月發布施行，將請原民會協助雅美(達悟)族的6個部落優先成為公法人，實施部落自治，讓部落成為集體權利的主體，自主管理一些公共事務，奠定民族自治基礎，從部落自治開始做起。
總統在聽過蘭嶼族人代表的想法與意見後，於總結回應時表示，針對蘭嶼自治的部分，政府會從部落法人開始打下一個良好的自治基礎，並且讓自治的程度可以持續深化擴大。
總統也提到，為提升蘭嶼的生活便利性，未來中央與地方政府將會共同合作，善用現有財源，讓所需要的建設都可以到位，解決環島公路失修、電信設施不足、服務品質不好，甚至電線及電線桿的地下化等問題，並且讓在地很多產業可以在良好的基礎上發展。至於醫療與長照等部分，未來也將納入施政重點，並將部落中的長照需求及服務納入相關規劃。