台電公司提案將目前放置在蘭嶼的核廢料遷回位於新北市的核一、核二廠，引發新北市政府反彈，新北市副市長侯友宜並認為北北基桃4縣市的態度應該一致，如果連核廢料都無法處理，還談什麼非核家園。
台北市長柯文哲也在會中指出，除了核廢料外，據他所知，目前核一、核二廠內還有上萬根燃料棒，這是整個國家的潛在威脅，也牽涉到電的發展，所以他認為中央應該與地方坐下來談，合力解決這個問題。柯文哲：『(原音)核能發電廠這件事情，是中央跟地方要一起，大家合作，很嚴肅去面對這個問題，也許我們下次首都論壇應該針對這個核能發電廠的事情，包括中央還有4個縣市大家坐下來大家好好談談要怎麼處理。』
柯文哲表示，他不是反核電，而是反對台灣有核電，因為台灣太小，不像中國，可以把核廢料或核電廠放在遠離人口的地方。
柯文哲並表示，他支持核一、核二加速退役，且不續建核四，但每個理想都有代價。他指出，台北市很認真發展再生能源，但目前台北市的再生能源還是只占3%，根本不夠，再生能源無法在短期內補上缺口，這是台灣必須誠實面對的問題；另外，柯文哲也表示大家必須有心理準備，若改用再生能源，電價就不可能這麼便宜。