簽署移交協議的消息讓許多民眾這才注意到，南京長江大橋原來這麼多年來一直歸上海鐵路局管？
澎湃新聞報導，但事實上，上海鐵路局這次移交給南京市政府的只是南京長江大橋的公路橋，鐵路橋部分仍歸上海鐵路局所有。
南京長江大橋於1960年建造，是中國大陸東部地區交通要道，是大陸第一座自行設計、施工跨越長江天塹的公路、鐵路兩用雙層式特大橋，多年來高強度服役。
據現代快報2013年報導，南京長江大橋多年來一直在修修補補，儘管如此，目前橋面、基座等部位出現多處裂縫。2007年，上海同濟大學的橋梁專家曾對長江大橋全面體檢，發現雖然「骨骼」狀態良好，但主橋局部構件、特別是公路橋面問題較多。
南京長江大橋雖然身在南京，但管理單位一直是上海鐵路局南京橋工段，資產也歸上海鐵路局所有。這意味著，未來最終的修補方案不僅要南京市首肯，主體大修還必須由上海鐵路局批准。