周玉蔻在民國103年指馬英九團隊收頂新集團新台幣2億元政治獻金，撰文指「拿了頂新集團秘密『獻金』的，正是馬英九總統」。馬英九自訴控告周玉蔻，並求償新台幣1000萬元及要求登報道歉。
台北地院審理後認定「周玉蔻有相當理由確信指摘內容為真實」，判決周玉蔻無罪。案件上訴，高院上午開庭，馬英九在卸任後首度以自訴人身分出庭，庭內多委由律師發言。
馬英九庭後受訪表示，今天是審判長請他來出庭說明，他下次還會再來。特偵組去年歷經6個月詳查，證明他們沒有收受頂新2億元政治獻金，也沒有圖利頂新。至於本案雖然一審敗訴，但也確認「我是清白的」。
記者問，周玉蔻消息來源、前國安會副秘書長張榮豐作證說頂新政治獻金價碼是2億元起跳，而不是說頂新給馬2億元。馬英九表示，「這一點應該是非常清楚了」。