針對漁業署要對前往太平島護漁的船隊開罰一事，有綠營學者就批評民進黨是「票太多」，對此，民進黨立委林岱樺今（1）日表示，就法規面來處理，漁民去護主權這件事，是給予一百分的支持，但過程中是否有違法的事情，可就要討論了，但是否要開罰，還有待商榷，因為處罰有很多種方式，包括警告、開很重的罰單、甚至溝通也是一種方式，所以要用甚麼方法，是可以斟酌的。
漁業署指出，前往太平島護漁的船隊，雖然是自發性的護漁行動，宣示我國在太平島的主權，但包括使用特許的活魚運搬船，以及3名領有船員手冊的鳳凰衛視記者上船隨行採訪，違反漁業法事實明確，漁業署確定將依照漁業法，「人、船分開」開罰，船員最重每人可罰15萬元，「海吉利號」最重可廢止活魚運搬船執照，漁業署將蒐集海巡署提供的資料進行調查，並與法制單位詳細研究後，最快兩周內，可對外公布裁罰名單與內容。
民進黨立委羅致政表示，所謂的開罰主要是在所謂的禁制區也好，或相關的規定，是照法律來走，但是如果這些漁船，當時的確照著當時申請的目的出港的話，應該也不會有相關的問題。