蔡英文總統在19日下午3時到6時15分於總統府舉行上任後首次國安高層會議。除了討論南海仲裁案後續及報告新南向政策外，也決定未來將常態性舉行國安高層會議。
總統在裁示時表示，為因應國家安全遭受的威脅與挑戰，定期召開國安高層會議有其必要性，希望凝聚執政團隊對於國家安全大政方針的共識，並做為總統決策時參考。總統府發言人黃重諺轉述：『(原音)總統裁示，認為為了國家永續生存跟長遠發展，尤其要因應國家安全遭受的威脅與挑戰，定期召開國安高層會議有其必要性，希望藉由會議的形式，聽取政府各部門首長提出的因應之道和具體行動的優先順序，同時凝聚政府執政團隊對於國家安全大政方針的共識，並做為本人決策的參考依據。』
此外，國安高層會議另針對國防軍事、區域安全及對外經貿戰略設有3個分項會談。總統表示，由於世界更趨多元化發展，國安議題不會僅限於傳統領域，面向已延伸到各種新興議題，也由於國際情勢瞬息萬變，許多即時性的國安議題都一再考驗政府處理的能力與智慧，所以她同意國安會規劃各分項會談，除了處理即時性議題，也能作為國安高層會議的輔助機制，增進總統決策的效率。
未來，大約每2個月召開1次國安高層會議，至於分項會談則會較為密集。
今天出席國安高層會議者，包括蔡英文總統、副總統陳建仁、行政院長林全、國防部長馮世寬、陸委會主委張小月、國安局長楊國強、國發會主委陳添枝、經濟部長李世光、海巡署長李仲威、外交部長李大維、農委會主委曹啟鴻、內政部長葉俊榮、國安會秘書長吳釗燮、總統府秘書長吳碧炤等。