台東市清潔隊統計，風災清出6600噸的垃圾，約台東100天的垃圾量，雖然高雄市政府答應焚燒台東的垃圾量，從1天50噸增加到80噸，仍沒辦法解決台東的垃圾危機。
李應元表示，行政院會全力協助重建，但是資源不要浪費，掩埋場和焚化爐都是垃圾處置的設施，應該一起處理，這樣才不會浪費資源，是否重啟焚化爐，是地方權責，他完全尊重台東縣民和縣長黃健庭的決策。
李應元表示，這次風災所幸有許多縣市基於「大家都是台東人」的精神伸援復建，才1個星期，台東街道就恢復90%的市容，效率令人欽佩。
黃健庭表示，縣府原本就有一套如何活化掩埋場計畫，但遭遇到風災，「遠水救不了近火」，重啟焚化爐的議題需要台東縣民、台東縣議會更認真的思考與面對。