針對南海仲裁法庭做出不利台灣的宣判，立法院內政委員會13日邀請行政院、內政部、陸委會、海巡署等單位，說明各部會的後續作為。
行政院副秘書長何佩珊表示，判斷本文以「中國台灣當局」(Taiwan Authority of China)不當稱呼我國，貶抑中華民國國家主權地位；此外，太平島並不是菲律賓請求裁判的標的，但法庭自行擴權，不僅將中華民國統治的太平島等島嶼宣布為「岩礁」(rocks)，也宣判不得擁有專屬經濟海域(Exclusive Economic Zone)，這嚴重損害台灣在南海諸島的法律地位及海域權利，政府不僅拒絕接受判決結果，也主張判決沒有拘束力。何佩珊說：『(原音)政府堅持南海諸島屬於中華民國領土，堅決捍衛太平島為一島嶼之事實，並絕對會採取堅定行動捍衛國家領土以及相關海域權利，絕不接受，也主張此仲裁判斷不具法律拘束力。』
陸委會主委張小月指出，根據中華民國在1947年公布的「南海諸島位置圖」，台灣對南海諸島及相關海域，是享有國際法及海洋法上的權利；報告進一步指出，兩岸對仲裁結果都各自表達立場，研判不至於會影響兩岸關係，不過，政府會密切關注大陸反應。張小月說：『(原音)研判南海仲裁結果，不致對當前台海情勢造成影響，兩岸關係是建構區域和平與集體安全重要一環，政府致力維持兩岸和平穩定發展，也密切關注中國大陸反應。』
海巡署報告則表示，相關巡防任務和強度，不會因為仲裁案減弱，也會視情況發展，適時增加巡護頻度。同時，海巡署也強調，南海偵巡任務有與國防部任務整合，偵巡期程交錯，以確保任務的延續性。