行政院農業委員會表示，部分區域因風雨阻隔，尚未至現地查勘，後續災情持續彙報中。
受尼伯特颱風強風豪雨影響，造成農業災情，經農委會畜牧處、農糧署、漁業署及林務局彙整各地方政府查報資料，截至下午5時止，農林漁牧業產物及民間設施估計損失約6億6380萬元，其中台東縣損失6億2663萬元最嚴重，其次是屏東縣損失1988萬元、高雄市損失1419萬元。
其中，農產估計損失金額6億4086萬元，農作物被害面積6686公頃，損害程度31%，換算無收穫面積2076公頃；受損作物主要為番荔枝（釋迦），被害面積4193公頃，損失金額4億6709萬元；其次分別為香蕉、其他特作、薑及枇杷等損失金額較多。
另外，畜產估計損失金額208萬元，主要是雞受損所致。林產估計損失金額17萬元，主要是林木受損。
民間設施損失方面，農業設施估計損失金額870萬元，以台東縣損失較嚴重；畜禽設施估計損失金額1199萬元，主要是畜禽舍受損，合計估計損失金額約2069萬元。