發生雄三飛彈誤擊漁船翔利昇號後，高雄地檢署專案小組主任檢察官王啟明、檢察官劉俊良立即於當天指揮高雄市警察局鑑識中心、刑事警察局鑑識中心及專責爆炸案件調查的偵查第五大隊等，登船進行相關鑑識採得相關跡證。
劉俊良並會同法務部法醫研究所法醫師潘志信，當天到高雄市立殯儀館進行複驗時，自黃文忠遺體上採得多件碎片跡證，供鑑識比對是否與雄三飛彈材質相符合。
經專案小組檢察官指示將其中25項可疑的金屬材質檢體，送交國家中山科學研究院進行鑑定，以掃瞄式電子顯微鏡、X光能量分散分析儀、紅外線光譜儀（FTIR）、熱裂解氣相層析質譜儀等分析，鑑定結果確定共有10件檢體，認定符合雄三飛彈材質。
被認定符合雄三飛彈的材質，其中包括在駕駛室頂、駕駛室天花板、駕駛室控制台、煙囪基部旁、上甲板左舷，以及黃文忠背部、左上臂、右胸、右上臂等所採集的檢體。
高雄地檢署襄閱主任檢察官黃元冠表示，經審酌公共利益的維護，為避免媒體及輿論揣測和偵查案件所查悉的事實不符，因此將科學鑑定結果適度公開，以昭公信，至於相關偵查作為包括還原真相、追查洩密等，持續進行偵辦中。
金江艦1日上午在海軍左營軍港誤射雄三飛彈，誤擊在澎湖海域作業的高雄籍漁船翔利昇號，造成船長黃文忠枉死，其他3名船員受傷。