根據草案內容，「反族群歧視法」的立法目的是為促進族群平等、社會和諧，防止及排除對特定族群一切形式的歧視，健全族群發展並落實保障人權。反歧視法的中央主管機關為內政部，在地方則為縣市政府，主管機關應邀集相關單位及社會公正人士，組成歧視申訴審議小組，審議申訴事件。
草案明訂，禁止歧視受教權、工作權，政府施行政策不得歧視特定族群，人民不得以惡意、污辱、脅迫性的文字、圖畫、言語、行為或其他形式的做法，歧視特定族群。民眾若遭受歧視，可在1個月內以書面向中央或地方主管機關申訴，相關機關應於1週內展開調查，並在2個月內完成調查，必要時可延長調查時間一次。
草案指出，主管機關進行調查時，案件關係人與機構必須配合調查並提供相關資料，若無正當理由拒絕配合者，將處新台幣3萬元以上、10萬元以下罰鍰，並可連續處罰。調查結果若確實有歧視情事，違反者應限期改正或停止歧視行為，否則將處10萬元以上、30萬元以下罰鍰，也可連續處罰。提案立委孔文吉說：『(原音)它的罪責，申訴的調查結果確有歧視情事者，主管機關應訂相當的期限，命該機關單位或個人予以改正或停止其歧視行為，逾期不改正或停止其歧視行為者，可以處新台幣10萬元以上到30萬元以下罰鍰，並得以連續處罰至改正或停止其歧視行為為止。』
內政部表示，目前只有澳洲及法國制定反歧視專法，美國、加拿大、紐西蘭及英國是將反歧視法令訂在人權相關法規內，日本則在刑法中明訂處罰等，是否要建立專法，建議進一步充分溝通與討論。此外，內政部認為，草案對於「族群」、「歧視行為」等要如何認定以及未來執行上對相關條文的認定適用恐仍有疑義，須進一步釐清。