民主進步黨籍立法委員段宜康日前指衛生福利部國民健康署長邱淑媞「厚臉皮」、「未能知所分際」，指她過去代表國民黨參選宜蘭縣長，如今又續任民進黨政府的三級文官，要求衛福部儘速處理。
邱淑媞隨後在臉書發文回應，強調她是公務員，並非政務官，2年前是為了還宜蘭培育之恩才以公務員身分參選縣長，一切合法。
但衛福部一週後仍宣布將調整國健署長職務，邱淑媞調任衛福部桃園醫院師一級醫師，接任國健署長人選徵詢中。
邱淑媞上午在臉書發文道別，表示今天將離開國民健康署，前往部立桃園醫院擔任顧問醫師，認為「可以思考、沉澱」，同時希望在教學、研究及健康促進業務上盡棉薄之力。
此外，邱淑媞表示她先生也曾在該醫院工作，認為「處處隨緣，處處有緣」，珍惜及感恩。