金門航空站指出，12日滯留機場的旅客人數有29名，航空站提供毛毯、空調等貼心服務。不過，今天卻傳出機場還有200~300名旅客滯留，並向媒體投訴。
航空站表示，今天一早就湧入未訂位旅客，排隊候補；旅客抱怨金門縣政府在重要節慶或連續假日，都會成立聯合候補機制，疏運返鄉旅客；但這次端午連假未協調航空業者加班機安排，以致他們訂不到機位，被迫滯留在機場，回不了家。
陳福海和金門航空站主任洪念慈下午到聯合候補櫃台區，關心旅客疏運情形、安撫旅客等待的情緒，同時實際瞭解登記聯合候補旅客人數為324人（往台北）；立即協調遠航晚上9時10分加開一班次；當場並辦理補位叫號作業，到下午3時30分實際只有97名候補旅客完成劃位手續，還餘60多空位。
航空站表示，旅客在進入聯合候補登記系統時，可以選擇1或2家航空公司，甚至4家全選；而一般旅客習慣全選，以增加候補機會；因此，候補櫃台螢幕上人數並不代表實際候補人數，通常只要看1家航空公司，就可看出大概候補人數。
航空站說，到今天中午11時30分，聯合候補系統顯示，登記候補人數高達250人（台北），實際清點現場候補人數只有80人。另外，縣府觀光處處長李增財等人也到場關心，提供礦泉水給旅客。
根據金門航空站數據，12日到站46班次，載客4438人，載客率96.75%；離站47班次，載客4813人，載客率100.88%，其中立榮航空往台北有5班更換加大機型；滯留往台北旅客24名、往台中旅客2名、往台南旅客1名、往高雄旅客2名，共29人。
金門航空站表示，今天表訂班次47航班，加上遠航晚上加班的1班次，共疏運旅客5000人，將可完成疏運。