環保指出，垃圾收運費用是處理費加上清運費，其中處理費由環保局定價，一般垃圾處理費用為每公噸新台幣2000元，包括家戶、社區大樓等垃圾；事業廢棄物代處理費用為每公噸2250元；清運費則因業者清運量、頻率及品質等服務差異，而有所不同。
由於台中市垃圾過量，市府在民國104年8月至12月期間協調高雄協助消化垃圾，為反映垃圾轉運期間至外縣市處理成本，環保局調整事業廢棄物代處理費用由每公噸2000元調整至2800元，並在今年1月轉運結束調回2250元；家戶、社區大樓等一般垃圾處理費，則仍維持每公噸2000元不變。
對於少數業者調漲一般垃圾處理費，環保局將協調管委會合約到期後改由環保局代為清運，不受業者漲價威脅，之後再商請公會協調其他會員以原價或合理價格繼續服務；業者若聯合壟斷及集體哄抬費用，則可交由公平交易委員會與消保官調查。