馬英九首次訪港是在1997年初，當時他剛卸任法務部長，期間他曾前往調景嶺舊址參訪，又參觀石鼓洲戒毒復康所。
當時，馬英九還曾到廣華醫院找尋自己的出生紀錄。當時廣華醫院高度禮遇馬英九，由院長陪同他複印生產證明文件。
此時馬英九剛卸任法務部長，姿態低調，多次搭乘地鐵（捷運）往返目的地，期間不時被乘客認出，但又質疑是否他本人，而馬英九主動承認身分，引來歡呼。
1999年3月，馬英九第2次訪港，此時他已擔任台北市長，而香港主權已經轉移。訪港期間，他由當時的行政長官特別顧問葉國華全程陪同參訪。
2001年2月，馬英九第3次訪港，此行他去了蘭桂坊及廟街等著名景點參訪。
亞洲出版業協會今天公布邀請馬英九於6月15日訪問香港，擔任「2016年度卓越新聞獎」頒獎禮晚宴的演講嘉賓。