520民進黨政府上台後，陸委會26日舉行首場例行記者會，媒體詢問焦點集中在兩岸兩會溝通聯繫機制、陸客人數減少等兩岸議題。對於相關問題，陸委會發言人邱垂正沒有正面回應，僅不斷重申總統蔡英文就職演說中對未來兩岸交流的4大基調，並表示政府立場非常堅定，已我方的展現最大的善意。
對於陸客減少的問題，邱垂正表示，政府會努力持續與陸方溝通，同時也會重新調整外來旅客結構，因應陸客減少所帶來觀光業出現的短期損失現象。
有媒體詢問，日前金門烏坵鄉發生大陸民眾在海邊釣魚遭到扣押，是否兩岸關係出現變化？邱垂正說，據了解，這個案子滿單純的，烏坵屬於要塞堡壘的管制區，未經核准不得進入，因此移送金門地檢署偵辦，現在羈押中。他強調，「中華民國是自由民主的國家，法律都會充分保障人權，『你放心』」。
而關於貨貿、服貿以及兩岸互設辦事處等協議是否繼續推動，邱垂正表示，要等立法院完成兩岸協議監督條例後，補足服貿、貨貿應有的監督程序，再來繼續推動。他進一步說明，貨貿還在進行業務溝通，尚未簽署文本，服貿則是已有協議文本出來，兩者是不同層次。
兩岸互設辦事處的部分，邱垂正強調，新政府會與公眾進行溝通，徵詢社會各界意見後做出評估，「但有關新生協議都必須等到監督條例完成，現階段就是持續進行準備工作」。
邱垂正在會中不斷重申，希望陸方珍惜過去20多年來協商交流的成果，兩岸藥方下歷史包袱，維繫陸委會與國台辦的聯繫機制與制度化協商機制，兩岸應透過良性溝通與協商建立互信，妥善處理爭議；對於兩岸間已經生效的21項協議，會持續敞開溝通聯繫的大門，減少大陸的疑慮與誤解。
有關海協會理事撰文批評蔡英文單身，邱垂正回應說，「我們的回答是不值得評論」。