新政府將在總統府內設「新南向政策辦公室」，由前外交部長黃志芳擔任主任。不過，部分立法委員質疑是黑機關，未來可能越過閣揆，直接指揮部長，現有制度行之有年，不需疊床架屋。
黃志芳上午在立法院受訪時鄭重澄清，他說，新南向辦公室是一個服務平台，拜託大家把它想像是一間服務公司，「它不是一個衙門，不是一個官衙」。
黃志芳表示，將來新南向辦公室扮演角色，就是很像互聯網，透過這個辦公室連結政府各相關部門、民間企業、工商團體、海外台商，以及教育機構、技職機構等，連結起來後找出一個最好的運作方式，是一個服務平台。
黃志芳表示，新南向辦公室一切設置都會符合行政體制的規定，對於外界質疑是黑機關，「我想這是一個誤解」。