政府是否開放含瘦肉精美豬進口，引發立法院藍綠對立，國民黨希望「新政府必須堅守牛豬分離原則，嚴禁瘦肉精美豬進口」案逕付二讀，卻遭民進黨團以人數優勢表決付委審查。
涂醒哲今天在嘉義市議會施政總質詢中，面對國民黨籍議員郭文居要求對美豬瘦肉精是否進口表態；曾任衛生署長的涂醒哲說，依據他個人的理念，食物最好不要含添加物。
不過，涂醒哲也表示，美豬牽涉到台灣與美國間的整體談判問題，牽涉層面比較複雜，他認為台灣社會對美豬議題的關注，是增加與美國談判的籌碼。
涂醒哲指出，根據他的了解，瘦肉精裡含有治療氣喘的藥，他認為國人應該關注的是美豬瘦肉精「量」的問題，中央應要有更正確、更宏觀的眼光來處理這個議題。
他說，若政府與美國談判結果，最後讓美豬進口，他認為在執行上一定要根據WHO（世界衛生組織）、日本或其他國家標準，並且要嚴格標示含量。
涂醒哲強調，若美豬開放進口，市府將會努力查察、大力宣導，要求民眾看清標示，不要吃含瘦肉精產品；若人民不吃，美豬就沒生意、沒出路，一切回歸市場機制。