世界衛生大會(WHA)的邀請函在9日報名截止日當天才寄到台灣，邀請函不但未附上網路報名的帳號跟密碼，邀請對象並為現任衛福部長蔣丙煌，且還提及聯合國2758號決議文以及「一個中國」原則。衛福部收到邀請函後，立即寄出回函，強調屆時將由新任衛福部長林奏延率團出席，林奏延也提供了我方代表團的名單。
衛福部表示，已於16日已收到世衛祕書處寄回的報名回函，當中並附有帳號密碼，我方報名所需的相關資料都已完成登錄，確定報名成功。
不過，世衛這次回函對象仍為現任衛福部長蔣丙煌，這是否讓新政府參加WHA產生變數？
衛福部國際合作組主任許明暉表示，我方已上網登錄新任部長林奏延所提供的團員名單，一切都照程序走，相信參加WHA沒有問題。許明暉：『(原音)這個是不用擔心的，回信給蔣部長是因為520之前他仍舊是中華民國的衛生福利的部長，所以他是具有代表性，但是這會不會對林部長的出席造成影響？我想這應該是不會。』
針對回函中再度提到聯合國2758號決議，連結一中原則，許明暉指出，衛福部已和外交部密切聯繫，大會現場若出現誤解我方立場的行為，會立刻清楚說明，不會讓我方代表團的尊嚴受到影響。許明輝：『(原音) 我們要專業參與及尊嚴參與，我們的尊嚴是絕對不容許受到任何的挑戰，只要我們的尊嚴有任何的挑戰，我們當然都會適當的回應。』
世衛大會將於23日登場，林奏延20日將啟程前往日內瓦，我方代表團包括疾管署長郭旭崧、國健署長邱淑媞、醫事司司長王宗曦等共24人，重頭戲為日內瓦時間25日上午林奏延在大會上發表演講。