馬英九總統任期只剩四天，是否可能面談中研院長候選人、圈選院長，各界矚目，已於4月17日聲明退出的傳聞候選人香港城市大學校長郭位，寫給馬總統的信函曝光，表明「無以應約面見鈞座」。
外傳候選人3人依序是廖俊智、周美吟、郭位。總統日前受訪說，他沒有和三候選人談過之前，不會貿然做任何決定，如果時間不夠，在徵詢準總統蔡英文之後來做，或者是由蔡英文來做，「我都沒有排除。」
至於傳聞候選人郭位是「馬友友」，馬總統日前也已澄清，他是在第2任才認識，過去在建中念書、服兵役時沒見過，直到日本311地震後，他讀了郭位出的一本相關的書後，請郭位到總統府相談才認識。
郭位委婉拒絕馬總統的會談，感嘆「社會紛亂，大道不行、小道橫行，正直誠信之建言者，反陷流言攻詰之境，有違學術獨立自主。」他並建議中研院「單純及虛級化」，以院士為主題， 研究單位併入各大學。
此外，中研院長任命須閣揆副署，但內閣已總辭，外傳馬總統針對中研院長人事案放話只是「打假球」，可能是要杯葛特定人。
法界人士推測，行政院長張善政不可能在「請辭中」的狀態副署，如果三位候選人未出席與馬總統的會面，總統可能將人事案退回中研院，而造成新政府的困擾。
或者在約見之後，「要求中研院退回重議，這就達到杯葛特定人選的目的了」，因為據傳中研院長候選人得票數最高的是廖俊智，而廖是蔡英文屬意人選。
廖俊智於5月13日公開「致總統馬英九公開信」，內容希望總統府先確認中研院長遴選過程的適法性，作為會面基礎，避免日後產生爭議。