立法院教育及文化委員會日前通過臨時提案，「請總統府與中央研究院分別針對中央研究院院長遴選辦法之解釋疑義」提出書面說明。
中研院的書面說明今天傍晚送到教委會，文件中說明中研院院長任期屆滿時的遴選方式及過程。
不過，中研院在書面說明中指出，回顧這次院長遴選過程與結果，意外發生外界的諸多紛擾，或將院長候選人名單公布，或質疑評議會臨時更改投票方式，導致選舉無效，或進行人身攻擊，意圖使候選人新生憤怒與畏懼而自動放棄。
中研院認為，種種作為皆顯示，要造成重啟院長遴選程序的議題，而紛擾背後的力量，會成為主要的受益者，這樣的結果與一個進步社會所標榜的公理與正義大相違背。
對於這次的中研院院長遴選，中研院說，總統馬英九日前已經對外表明部會退回之前呈送的院長候選人名單，且將在近期內約談候選人後，決定新任中研院長人選，中研院深切期盼相關紛擾可以就此消散，中研院的穩定可以重新恢復。
教委會召集委員、國民黨立委陳學聖說，現在看起來中研院覺得他們的遴選過程沒有違法，所以總統府應該做決定，尤其這事情可能跨520前後，所以希望馬總統與總統當選人蔡英文儘速協商，決定要不要退回、還是重新遴選，或是照現在程序走下去，如果要繼續遴選下去，也不要再傷害三位候選人，因為如果懸而不決，他們學術名聲會受到很大傷害 。
他說，應該讓政治歸政治、學術歸學術，讓好人選重新帶領中研院。