嘉義縣家畜疾病防治所運送71隻犬時悶死40多隻，引發輿論抨擊，媒體大篇幅報導駭人場面；但找出問題、對症下藥，才能避免這類憾事再次發生。
其實動保領域不僅止於寵物動物，還有經濟動物與實驗動物。但經訪動保業務中央主管機關農委會獲知，中央主管機關的動保業務，僅於農委會畜牧處下設動物保護科1個科，編制內人力僅5人，即科長1人及4名技正，另外有3名計畫人員，但僅是約聘僱人員。
預算方面，農委會表示，今年資本門預算約2億元，已核編給全國各縣市政府改善收容所硬體建設使用；另7000多萬元，其中3000多萬元補助地方政府人事費、3300多萬元用於補助節育，剩1000多萬元做其他事。
以這次引發爭議的嘉義縣為例，據悉，還是農委會主動請縣府提出收容所改善計畫後，地方才提出的，然後農委會先行核予177萬元規劃預算，之後再補助施工經費。
此外，多數地方政府改建收容所約費時2年多，每案約動支2000多萬元，由農委會逐年編列預算補助。
農委會畜牧處動保科科長江文全說，各地方民情各有不同， 6都相對於農業縣市，比較重視流浪犬的權益，地方政府提出改建收容所的態度與作為亦較積極。
不過即便同為農業縣市，各地狀況也不同，江文全舉例，像宜蘭已改建完成；而傳出1女獸醫忍受收容所惡劣環境顧流浪犬的嘉義市，7、8月也即將動工；雲林則因地方人士反彈，尚採行分散在各家動物醫院收容的方式處理，農委會已協助與地方人士溝通，期望能儘快建造收容中心。
台灣動物社會研究會主任陳玉敏說，動保界多年呼籲農委會下應改設「動保司」，一直沒有結果；軟硬體嚴重匱乏也遍及各地方政府，這次引發爭議的嘉義縣收容所，就只有1名獸醫、1名技正，同時負責照顧一百、兩百隻流浪犬，「要不出狀況，恐怕很難」。
她進一步指出，合格的收容所必須有人每天記錄流浪犬行為，包含是否過度舔毛、怯懦或有敵意，以及是否有拉肚子等疾病，否則就算被認養，也易因種種問題被退回；若是只求「不死就好」，也會因空間太擠而發生互咬情形。
陳玉敏強調，設動保司、強化中央與地方的軟硬體條件之外，更關鍵的是，台灣動保政策一直沒有前瞻性、沒從源頭防堵問題，例如歐洲對飼養寵物管很嚴，台灣卻是繁殖買賣無限制，認養更沒優於買賣。