衛福部臺南醫院組成臺南市第一個、也是參與最多基層診所的醫療照護團隊-「南醫居家醫護團隊」。
臺南醫院配合健保署「全民健康保險居家醫療照護整合計畫」，整合臺南醫院的居家護理所及「全民健保家庭醫師整合計畫」之社區醫療群診所，服務因失能或疾病狀況不便外出就醫之患者，改善現行居家醫療照護片面的服務模式，並連結社區照護網絡，提供住院替代服務，以達到「到宅服務」及「在地老化」。
李伯璋院長表示臺南醫院的「南醫居家醫護團隊」是全國目前結合最多家基層診所的團隊，除了衛福部臺南醫院本身的5群社區醫療群內的31家基層診所加入以外，新化分院亦納入此次醫療整合計畫中，並進一步連結成大醫院的社區醫療群加入，期望擴大「南醫居家醫護團隊」服務範圍，使醫療資源缺乏地區民眾也可享有住院替代服務。
整合後的臺南醫院「南醫居家醫護團隊」堪稱全國陣容最大之整合團隊，有15群社區醫療群包括55家基層診所聯合提供服務。服務之專業醫療人員包括各專科及基層醫師、護理師、呼吸治療師、藥師、物理治療師、社工師等，可提供連續性、完善的到宅居家醫療服務，強化個案健康管理，並設有24小時電話諮詢服務，讓居家醫療服務不中斷。
衛生福利部臺南醫院運用醫療整合模式，除了傳統的三管(鼻胃管、尿管及氣管內管)為主的一般居家照護外，更提供居家醫療(在宅醫療)、重度居家療護及安寧療護服務。讓行動不便患者、呼吸器依賴患者及末期病患安寧居家療護者，在家也可以得到完善的照護。「南醫居家醫護團隊」的成立，可以強化在地的醫療服務，提供民眾即時、方便與完善的醫療照護，守護台南及偏鄉地區民眾的健康。