總統當選人蔡英文今天(29日)到外交部聽取簡報，在結束後走出外交部時，記者問到是否談到沖之鳥議題，並問到未來要如何捍衛漁民的權利。蔡英文握拳表示要「全力捍衛」。外交部長林永樂則在會後轉述，他在會中特別向蔡英文說明這次沖之鳥事件發生的情形，目前政府採取的措施、向日方提出的抗議、馬英九總統目前的政策，以及我方希望以和平協商的方式解決未來的爭端。蔡英文則認為我方目前還是要能與日方繼續協商。