曹啟鴻今天在寶島新聲接受紀錄片導演李惠仁訪問，做出以上表示。李惠仁質疑，台灣的口蹄疫情改善進度慢於菲律賓。
而農委會今年3月14日才公布，去年10月向世界動物衛生組織（OIE）申請認定台灣本島、澎湖及馬祖為施打疫苗口蹄疫非疫區案未通過，因有疫情的金門產品輸台等因素所致，明年再申請。
曹啟鴻說，這確實是很棘手的事，目前有打疫苗的豬占80%，有人覺得未施打的20%豬隻沒發生疫情就是哨兵豬，但他覺得要更小心一點處理，因此他要跟農委會同仁再做討論，初期他覺得要打最後一針，「但要確定是有效的，因此他要跟同仁討論決定後再去做。」
李惠仁則說，過去農委會就是用補一針的作法因應，使得至今疫情沒完沒了。
曹啟鴻仍認為，他會區分為A、B、C、D級去施打，「如果D級要打，沒徹底執行，才會有漏洞」，「要補、就要補到位，公權力要徹底執行。」
他舉例，過去他問過獸醫，被告知「農民很兇，不給做（打疫苗）」，未來他執行時會請國防部化學兵協助執行。
他反問，「為何不做好，讓負擔減輕呢？過去補一針沒徹底，農委會近期已報OIE沒過，要再努力，致力改善，況且很多養豬戶也希望能外銷。」