立法院院會19日才剛表決完「促進轉型正義條例草案」的復議，民進黨團以多數優勢否決復議提案，讓相關修法維持付委審查狀態，立法院司法及法制委員會21日就隨即排案審查民進黨團擬具的「促進轉型正義條例草案」。
由於民進黨版內容，主張在行政院轄下設置獨立機關「促進轉型正義委員會」，行政院秘書長簡太郎21日受訪時指出，根據「中央機關組織基準法」以及「行政院組織法」規定，目前並不適合在行政院下再制定新的組織機構，如果認為目前處理轉型正義的法令不足，可以透過修法或其他方式，以避免法律競合問題。簡太郎說：『(原音)依照行政院組織法的規定，大概只可以有3個獨立機關，目前已經有3個，如果再加上這個，就變成第4個，這樣就有違反原來組織法基準法的精神，所以我們覺得不宜。如果真的有轉型正義的必要，可以從制定法令或修法著眼，避免跟其他法律有競合現象。』
簡太郎也說，行政院只是提出立場及看法，希望講道理的立法院可以共同探討。簡太郎說：『(原音)立法院應該也是個講理、講法的機關，我們大家共同討論探討，希望可以得到圓滿的結果。』
行政院書面報告中指出，民進黨建議的「促轉會」，不僅違反憲法部分條文意旨，也與現有法律有競合問題，此外，也涉及司法機關權限，因此行政院認為，社會對修法還有歧見，應進一步待凝聚社會共識。