中研院組織法規定，中研院長任期5年，連選得連任一次。翁啟惠於2006年接下前任李遠哲的棒子，並於2011年續任院長，任期至今年10月18日屆滿。
按照中研院長遴選程序，先由遴選委員會經公開徵求、學界推薦等方式，挑出4位以上的候選人，再由今天召開的評議會投票，選出3人名單送至總統府，由總統圈選。
中研院依規定不能揭露候選人名單，今天上午會議召開前，參與會議的評議員陸續進場，見到大批媒體在門口堵訪，大都低頭快步走開。前教育部長曾志朗約9時抵達，受訪時只笑笑地重複說了二次，「選最好的就好了」。
前成功大學校長賴明詔表示，翁啟惠身陷浩鼎案後，多少會擔心影響院長遴選，減低優秀人才出任的意願。他認為下一任院長要努力恢復中研院名聲，畢竟國家很多重要的發展方向，都需要中研院給予建言，台灣的生技產業也需要繼續發展。
翁啟惠昨天在松山機場受訪時，特別感謝前院長李遠哲在近來浩鼎風波中，給予許多寶貴的建議。但今天李遠哲低調不回應，對於下任院長的人選，他只說，「評議會有一定作法。」