教育部高教司科長曾新元表示，私校法第43條規定，在校長利用職務機會犯罪、提起公訴，學校法人可予以「停聘」；經判決確認有罪、嚴重違反教育法令、或有損師道情節重大等，可予以「解聘」。
曾新元說，高醫大董事會新通過的「校長監督及考核辦法」，規定校長經「考核」沒改善，可予以解聘。疑似是在私校法第43條外，又額外訂出新的「解聘要件」，恐有違法疑慮。
另外，外界盛傳高醫大董事會修正修正校長考核辦法，若1/2董事出席，且經出席的1/2董事通過，即可解任校長職務。曾新元表示，目前教部收到的版本中，並沒有上述條文，仍是依照「私校法」第32條的規定，即2/3董事出席，出席的1/2董事通過，才能解任校長職務。
曾新元總結，目前初步審視，高醫大新的「校長監督及考核辦法」，在解聘校長部分，「程序」合法，而是「解聘要件」有問題。除此之外，還有一些條文有爭議，教育部彙整後會行文董事會，要求必須符合相關辦法。