民進黨9日舉行勝選後的第一次全國黨代表大會，共有267名黨代表齊聚一堂。因應即將重返執政，會中通過「穩健改革，團結台灣」的大會宣言，訴求民進黨會全力實踐五大社會安定及五大政治改革的承諾，並著手規劃攸關民生經濟、社福勞工、教育文化、民主人權、制度改革等重要法案的制定與研修。而穩健是手段，改革是目標，團結則是後盾。
此外，會中也通過修訂民進黨「黨章」，讓中央政府政務官員免兼黨職，也就是民進黨執政後，副總統、總統府正副秘書長、中央政府正副院長、秘書長、政務委員及部會首長與政務副首長的黨員，不再是「當然黨代表」；副總統、行政院長、總統府秘書長不再是「當然中常委」，落實行政中立、全民政府，此項條款也被視為是為非黨員的準副總統陳建仁、準閣揆林全免兼黨職解套。
黨主席暨總統當選人蔡英文表示，政務官不用兼任黨的中常委，讓政務官和黨的關係成為真正的合作夥伴，而不是聽命辦事的上下從屬的關係。她說：『(原音)他們是向台灣人民負責，不是向民進黨的中常會負責，這就是我們今天修改黨章的一個非常重要的意義。』
除了政務官免兼黨職外，黨章也通過修訂直轄市長、縣市長、黨團三長等具有直接民意基礎者，可繼續擔任「當然中常委」，確保黨意不會凌駕民意。
同時，會中還通過修訂「財務管理條例」、「公職候選人提名條例」、「紀律評議裁決條例」、「廉政條例」等修正案。其中，「廉政條例」修正案中，新增黨員涉及「違反利益衝突迴避」的行為而影響民進黨名譽，廉政委員會得進行調查並作成處分裁決，這項修正案被外界解讀為「翁啟惠條款」。不過桃園市長鄭文燦受訪時駁斥，強調翁啟惠非民進黨員，一切是大家想太多。