台南地檢署襄閱主任檢察官陳建弘表示，維冠金龍大樓倒塌案造成115人死亡，2月6日案發後就指派主任檢察官江孟芝、檢察官蔡佩容、蔡宗聖、王聖豪；及具各項專業背景的檢察事務官多人組成專案小組進行偵辦。經多次搜索傳喚後，向法院聲請羈押林明輝及建築師鄭進貴、張魁寶獲准。
陳建弘指出，檢察官認為維冠公司負責人林明輝、設計部經理洪仙汗、大合鑽探技術顧問公司結構部結構技師鄭東旭、鄭進貴、張魁寶等5人涉犯業務過失致人於死罪嫌，犯罪事實明確，均予以提起公訴，並建請法院判處最重刑度。
檢方指出，鄭東旭負責維冠金龍大樓結構分析與設計，計算大樓建築物靜載重時，漏未計入柱、梁重量的結果，使建築物靜載重至少不足約44.3%；致原設計的抗地震橫力約減少16.3%，造成柱、梁構材設計強度不足，斷面尺寸所配鋼筋量減少甚多，大幅降低建物抗震力。
檢方指出，林明輝為節省建築師繪圖費用及營造成本，指示洪仙汗指導維冠公司設計部繪圖員繪製所有建築設計圖說；施工時又擅自減少梁柱接頭配筋量及縮減部分柱斷面尺寸。
檢方發現，林明輝再委請鄭進貴以張魁寶名義擔任設計、監造人，再向大信營造公司借牌自行施工；於民國82年2月至7月間未設置工地主任，也沒有合格技師確實到場勘驗。施工時為偷工減料，採用拉力不足的鋼筋，約等同鋼筋數量不足1/3；梁柱接頭未按圖施作箍筋，續接器品質及施工也有不當情況。
檢方指出，林明輝等5人的各種疏失，造成維冠金龍大樓耐震強度、韌性不足，在地震後快速倒塌；且倒塌後建物無法維持完整結構崩毀，使住戶受困難以逃生，造成嚴重傷亡後果。