「教改論壇」召集人、國立台灣師範大學名譽教授吳武典表示，中央研究院已創立88年，隨著社會變遷，中研院逐漸走出學術象牙塔，對社會和產業的關懷與介入也愈來愈深，但此次院長翁啟惠涉入浩鼎風波，已涉及分際問題，他呼籲翁啟惠趕緊說清楚，不要「一失足成千古恨」。吳武典：『(原音)我們實在不忍心看到他因為這樣的事情前功盡棄，所以我們奉勸院長趕快回來、趕快回來，誠實就是最好的策略。』
國立政治大學教授周祝瑛則指出，中研院隸屬總統府，地位崇高，每年的總預算比全國高等教育的總預算還多，國內學術界許多研究規則也都出自中研院，內部人員近幾年更為政治、課綱等議題連署或站台，政治中立性備受質疑，這樣的機構應被適當監督、評鑑，否則，絕對權力將使人絕對腐化。周祝瑛：『(原音)今天任何一個公部門的機構，如果缺乏適當的監督評鑑的話，有時候會忘了時代的需求。』
學者建議，未來中研院院長人選不僅應有卓越的學術成就和聲望，更要避免成為正在進行中的重大研究案主持人，以防範有球員兼裁判之嫌。