根據民進黨所擬具「兩岸訂定協議監督條例」草案規定，立法院對於協議草案的審定，應在90日內完成，對協議本文的審查，應於30日內完成，但經決議可以展延10日，協議草案與協議本文之審查若逾期未完成，視為同意。
這項「逾期未完成視為同意」的規定遭外界認為是「自動生效條款」，陳亭妃解釋，草案根據談判前、談判中這兩個階段都訂有嚴格審查機制，公聽會、逐條審查、風險評估等，做成決議後，根據立法院決議所簽署內容，也就是在最後階段設定時間表，不能一直擺著不處理。
陳亭妃說，這與國民黨執政時期，未經國會討論與審查，就要國會全數買單、自動生效的作法不同，絕非自動生效條款，兩者南轅北轍。
2014年1月民進黨曾提出「台灣與中國締結協議處理條例草案」，2016年的版本名稱改為「兩岸訂定協議監督條例草案」，但內文未特別定義什麼是「兩岸」，僅在第1條說，「本條例未規定者，適用台灣地區與大陸地區人民關係條例及相關法規的規定」。
陳亭妃表示，這個兩岸訂定協議監督版本已經是最嚴格的版本，仍須經黨團會議討論後，才能正式對外提出。