杜紫軍聽取相關部會報告後表示，台南市政府所報地震災損重建需用經費，核列新台幣32.8億元，至於學校校舍耐震改善、老舊建築檢查及提報土壤液化示範計畫部分，均另案審議協助核列經費。
針對台南市0206地震災損金額審查結果，主計總處表示，台南市政府原提報經費需求54.3億元，於審查過程中重新檢討調整後修正為47.6億元，其中校園復建補強10.9億元，未來將納入教育部「公立國中小校舍耐震能力及設施設備改善計畫」辦理，中央再另案審議協助。
主計總處表示，其餘尚待協助事項需求數改列為36.7億元，經核列32.8億元，包括中央協助災後復建工程等10億元、地方災害準備金支應搶修搶險等6.4億元、原預算調整支應0.08億元，以及地方收到民間捐款支應民間建物補強及重建等16.3億元。
主計總處指出，高雄市政府原提報建築物安全評估4億元，將納入內政部「安家固園計畫」辦理，未來中央再另案審議協助，其餘尚待協助經費核列1.2億元；嘉義縣政府提報經費需求核列0.3億元；雲林縣政府經費需求核列0.2億元，均由各縣市政府災害準備金支應。
杜紫軍表示，這次震災復建所需經費，除台南市政府災害準備金不足，由中央協助從寬處理之外，其他3縣市政府均可在災害準備金範圍內支應。然而考量今年還有3季，因應未來3季的災害準備，暫不要求地方政府以緩濟急，若未來地方災害準備金不足，中央當依法協助。
關於危險建築物拆除補強方面，內政部表示，0206震災後，台南市政府及高雄市政府已完成危險建築物緊急評估工作，其中，台南市政府張貼紅色危險分級標誌建築物計255棟，張貼黃色危險分級標誌建築物計339棟。內政部將補助直轄市或縣市政府辦理災害後搶險措施的危險建築物拆除經費。
此外，僑委會指出，海外商會募得2000多萬元捐款，將優先用於代償震災罹難8位學生的就學貸款，也將捐助37位受災戶學生助學金，及21位學生所需資訊設備。