立法院民進黨團日前下令，要求黨籍立委撤回各自泛屬「兩國論」版本的《兩岸協議監督條例》草案，共同支持回歸中華民國憲政體制的黨團版本。民國黨對此表示肯定，也提醒民進黨，不論在野或執政，對同樣的政策不應出現兩套標準，更不要說一套、做一套，千萬不要淪為兩岸「不協議」條例。
民國黨主張，兩岸間應「溝通合作，和平發展，變異求同，一體雙贏」；並認為兩岸持續合作交流是維持兩岸和平發展的關鍵；要推動兩岸合作制度化，就需要簽署協議，而之前民進黨部分立委，不但將兩國論入法，還動輒對談判人員施以刑罰，根本就是「不協議」條例。兩岸無法談判簽署協議，就不能合作。不能合作，就難以維持和平發展。總統當選人、蔡英文主席承諾的「維持（兩岸）現狀」也將化為泡影。
另外民國黨也提出，像是副總統當選人陳建仁副院長極力主張的兩岸生技醫藥產業的合作，就仰賴《海峽兩岸醫藥衛生合作協議》。由此來看，民進黨執政後，不應該否定兩岸合作，還應該把合作推廣到所有產業，而不是獨厚特定少數產業。