針對外界質疑「國家資通安全科技中心」成立，科技部特說明指出，資通安全已成為國家安全之重大課題，相關精進的組織調整與業務的推動，刻不容緩。行政院於103年5月指定科技部為資通安全主管機關，加速推動相關工作。
科技部表示，為提升國家資通安全防護能力，推動資通安全科技發展及應用，規劃將行政院國家資通安全會報技術服務中心行政法人化為「國家資通安全科技中心」(簡稱資安科技中心)，賦予其執行特定資安「公共事務」的權責，亦藉由引進企業經營精神，期融合公、私組織之優點與特性，提升其執行業務之專業度及有效性。「國家資通安全科技中心」設置條例經立法院三讀通過，並奉行政院核定於105年1月20日施行。
科技部表示，資安科技中心成立後，將強化我國關鍵基礎設施的資安防護工作，推動資安科技之研發、整合與應用，以及支援產業資安重大發展策略等功能，成為守護我國資通安全之精實專業團隊。
科技部表示，資安科技中心業務職掌包括：蒐集政府、學術及民間網路資安威脅資訊，建立跨政府機關資安監控機制；研析我國面臨之各類資安威脅，並透過公私協同合作關係進行資安情報資訊分享；全時監控機敏機關網路，精進國家重大資安事件應變，舉行大規模資安攻防演練，輔以定期稽核、健診及滲透測試等服務，及早發現政府與關鍵基礎設施資安問題；規劃舉辦資安系列競賽擴散學校資安教育成效與提升全民資安認知；進行資安服務系統開發，在遭遇資通訊攻擊或威脅情況下，能有效支援及協助相關單位進行反制。
科技部表示，依據國家資通安全通報應變綱要，關鍵資訊基礎設施(如高鐵與台電)，在發生資安事件都必須項國家資通安全通報應變網站進行通報，進行應變處置。同時依據行政院及所屬機關資通安全分級作業要點，包括高鐵與核能電廠等涉及關鍵基礎設施國公營事業，必須依照資通安全應辦事項規定由政策面、管理面、技術面及訓練面等推動資安防護工作，爰由科技部及資安科技中心各司其職，緊密合作。
科技部表示，資安科技中心董監事名單均是依照該中心經立法院三讀通過之設置條例，由政府相關機關代表、資通安全研究相關之學者、專家及民間企業經營、管理專家或對資 通安全有重大貢獻之社會人士組成，主要考量的是資安與管理的專業性。藉由資安科技中心的成立，有利於強化我國整體資安防護能量，提升國家競爭力。