林寶水是淡江電算系首屆校友，1976年進入長榮集團，曾派駐美國、英國，1999年升任長榮航勤總經理，因表現優異，2002年晉升長榮航空首席副總，2004年升任長榮航空總經理，2005年至2011年接任長榮航空董事長。
林寶水是長榮集團40年的老臣，也是忠臣，在公司表現受肯定，但他知所分際，當年長榮集團總裁張榮發栽培小兒子張國煒在長榮航空的發展，即使林寶水位階比張國煒高，但每當有媒體的場合，林寶水一定自動退居一旁，將舞台留給小老闆。
林寶水曾擔任過長榮集團資訊中心主任，並利用他的專業，協助長榮海運全面電腦化。
長榮航空2004年向波音增購8架B777-300ER飛機，就是林寶水任長榮航空總經理時簽下的合約。
林寶水離開長榮航空後，接下長榮鋼鐵董事長職務至今。
林寶水謙虛隨和，長榮航空員工得知是林寶水回任，都對這位老長官帶人帶心的管理方式，豎起大拇指。