國防部11日下午公布「憲兵隊進入民宅調查案」行政調查結果，政戰局長聞振國中將記過兩次，憲兵指揮官許昌中將申誡一次；主辦案件的保防安全處長趙代川少將，記過三次，則是處分最重。
針對外界質疑搜索民宅為何沒向檢察官申請搜索票，國防部總督察長室總督察長韓更生中將表示，2月19日下午1430時，由趙代川主持專案會議，邀請國防部法律司、軍事安全總隊、台北憲兵隊等單位共派員9人參加，會中法律司副處長蕭斐全上校曾建議，先依據《國家機密保護法》判斷魏某販售的文件是否仍在保密期限之內，並建議報請檢察官開立搜索票。
韓更生表示，台北憲兵隊出席人員黃明瑞上校，也曾建議依案情由檢察官開立搜索票，以進行強制處分。不過，相關提議最後都未獲接受。
至於為何沒有一開始在捷運站碰面就錄影，韓更生表示，接受調查憲兵人員表示，由於車內光線昏暗，因此並未進行錄影。