依據疾管署統計，國內流感併發重症通報數自2月22日達到高峰後，通報數緩慢下降，已過感染高峰期。不過，因疾病病程影響，上週新增314例流感併發重症確定病例，死亡新增37例。自104年7月流感季以來，累計1423例重症，121例死亡。
疾管署依據美國的流感預測方式預估台灣流感季狀況，約有1000人到2200人死於流感相關疾病；至於今年流感重症死亡，預估至今年3月底累積流感重症個案數約為1800至1900人，死亡數約為230至290人。
郭旭崧表示，這樣的預估數字確實是這幾年來比較嚴重的數字，但公布預估數字也希望有示警效果，就像氣象預報強烈颱風來襲，民眾就會提高警覺一樣，達到降低流感疫情的效果，此波疫情預估3月底可以脫離流行期。
至於預估數字嚇人，是否引起恐慌？郭旭崧表示，疾管署發佈數字都很慎重，就是擔心政府動作太大會產生恐慌，造成不必要的死亡。如他父親當年因為SARS疫情，本來3月就要就醫檢查卻不敢去，延到11月就已經太遲。
他說，預測不一定會準，颱風預測也不是每次都準，但勇於預測總比外界數字造成恐慌好一點。
根據疾管署資料，受到疾病潛伏期及病程影響，這波流感疫情於過年達感染高峰，第7週達發病高峰，第8週重症病例通報急速增加，上週（第9週）輕症及重症人數已逐漸下降，但預估死亡人數未來仍會持續累積。
此外，流感疫情應變屢遭外界質疑，郭旭崧7日在立法院備詢時也說，已就流感因應作為向衛福部自請處分；他今天下午提出疾管署組織調整，2名副署長周志浩、莊人祥不再任發言人，有媒體質疑是署內懲處？
郭旭崧說，此舉不是懲處，「要負責任的是我一個人」。這次造成民眾有很多不解，也傷害地方、中央防疫人員，「這種信任的折損責任在我身上」。