行政院長張善政7日中午臨時舉行記者會，說明政府對憲兵搜索爭議的立場。他指出，出動憲兵向民眾索回老舊文件資料的妥適性有待商榷，他也認為相關知情主管應該暫時調離現職。
行政院發言人孫立群表示，馬英九總統與張揆在今天的例行性會議中討論此案，張揆認為社會對此案件高度關注，應該儘速處理；因此，府院達成共識由行政院出面召開記者會表達立場。孫立群說：『(原音)這有幾個層面，大家也知道國防、外交、兩岸是總統職權，院長也深刻體認到民間對整件事情質疑，今天跟總統有例行性會議，也有共同共識，院長覺得這種事情必須釋疑，所以事不宜遲，越快越好。』
孫立群也表示，暫時調離現職的主要原因是希望檢方能順利調查此案，進一步釐清真相。他表示，行政院的4點說明有和府方交換意見。