張善政中午12時30分舉行記者會說明憲兵入民宅搜索事宜。張善政表示，這幾天外界對於憲兵到民宅去所謂搜索白色恐怖文件是否妥當的爭議，行政院有幾點看法。
張善政表示，首先，這起案件，從國防部政戰局決定去進行調查的決策方，到執行階段的憲兵指揮部，為了讓未來調查順利，應該把相關主管暫時調離現職，靜候調查。至於調離的層級，由國防部去調查，政戰局和憲兵指揮部「知情的最高主管」應該調離現職。
張善政表示，第二點，這起案子目前由檢察官剪報分案調查，行政院不去干涉調查內容與過程，但希望檢察官能用最快速度釐清事實。了解到外界關切，希望檢方在不影響調查過程的前提下，用最大開放度，把案情內容適時對外界說明。
張善政表示，第三點，這些文件是50年前的文件，在20、30年前應該銷毀，但沒銷毀流落到民間，現在去針對流落在外的文件，進行洩漏機密的調查，到底是否合適，「妥適性有待商榷」。
張善政表示，第四點，案件對象涉及民間，是否適合由憲兵進行，這部分有問題，比較理想做法應該是透過檢察官體系，由檢察官依法發搜索令，再由警調去做，而不是由憲兵去做。「假使這件事情真的該做，應該是這樣做」。
張善政表示，雖然國防部說當事人有同意搜索，但一般民眾對於公權力總是有些敬畏，比較好的做法還是應該拿到搜索票。透過憲兵去向民間索取資料，「這個做法相當不妥」。
對於國防部強調憲兵為司法警察官，可進行調查。張善政表示，憲兵依法有權限，但什麼時候用？譬如早年要查地方賭博案，檢察官可能顧慮警方和賭場勾結，因此調用憲兵，避開當地警察，像是這種案例就合適由憲兵調查。憲兵調查應該「因案制宜」。
媒體報導，網友k9t8u5（朝天椒好辣）在批踢踢BBS站八卦版發文指出，他父親收藏白色恐怖相關文獻，2月28日前幾天憲兵到他家搜查，扣押文件，並用廂型車把他爸載到偵訊室裡質問。