關於媒體報導「大型農企，不能免稅了」，農委會特別說明，目前規定農民生產初級農產品不需繳營業稅及所得稅；農企業如為公司型態，經營初級農產品不需繳營業稅，但須申報營利事業所得稅。而針對少數農民因經營型態、規模擴大，投資設備、雇用多位員工，以及行銷流通方式，被財稅單位認定為「營利事業」，而須申報營利事業所得稅，造成疑義，農委會與財政部兩部會乃於3月4日開會研商，雙方就農業產業政策、現行課稅實務進行初步溝通瞭解，後續將蒐集各產業農民經營型態、規模分布等資料，並瞭解業界意見，俾供兩部會持續研議可供認定「農民自力經營」與「營利事業」之標準，兼顧提升農業競爭力與賦稅公平性。
農委會表示，依據現行營業稅法，農民生產初級農產品及其加工品不需繳營業稅。依據所得稅法，農民「自力耕作、漁、牧、林」之所得，依財政部公告，成本及費用得以百分百扣除，所得稅實質免稅。此等對農民之優惠規定，仍將維持，不會改變。由於營業稅係對物免稅，公司型態之農企業經營初級農產品不需繳營業稅。但所得稅方面，依據所得稅法規定，公司為營利事業，本來就須申報營利事業所得稅，本項規定亦沒有改變。
農委會持續鼓勵與輔導農民擴大經營規模，提升競爭力
農委會指出，為提升農業競爭力，政府積極輔導農民擴大經營規模，如小地主大專業農政策，但亦衍生少數農民因經營型態、規模擴大，投資設備、雇用多位員工，以及行銷流通方式，會被認定為「營利事業」，而需申報營利事業所得稅，故農委會與財政部兩部會為共同協助農民，避免影響農民擴大經營規模意願，雙方就「營利事業」、「個人經營」認定標準開會溝通，期能解決相關疑義。
兩部會開會以交換意見為主，未改變現行賦稅規定
農委會表示3月4日兩部會會商以交換意見為主，雙方就農業產業政策、現行課稅實務進行溝通瞭解，將透過蒐集農民經營規模有關資料，探討如何在維持現行賦稅規定之前提下，共同研議較明確之「自力耕作、漁、牧、林」與「營利事業」之認定標準。本次會議決議，對於認定標準應考量產業政策需求及課徵實務，以及我國加入TPP擴大農業經營規模之政策發展方向，由雙方持續蒐集各產業經營型態、規模分布，並瞭解業界意見，以訂出可供農民及稅務稽徵人員明確依循之認定標準，兼顧提升農業競爭力與賦稅公平性。