流感疫情雖然趨緩，但龐大的病患量仍衝擊各地醫學中心急診室，讓第一線醫療人員不堪負荷，也對其他疾病病患產生排擠作用。為解決相關問題，台灣急診醫學會1日拜會衛服部，雙方討論後決定，將建立常態機制，由政府指定緊急應變醫院，專門收流行疾病病患。
衛福部主任秘書石崇良表示，包括本次流感及未來重大流行病疫情期間，衛福部在監控疫情時，也一併把醫療量能納入監控，若發現病患就診情形造成衝擊等情況，就會啟動緊急應變機制，將由衛福部及地方衛生局指定應變醫院，專門收治流行疾病病患，以讓其他醫療體系能維持正常，紓解第一線急診同仁的壓力。石崇良：『(原音) 這個大家也有共識，對於部分地區，特別是醫學中心，發生急診壅塞、收治困難的區域，我們會跟地方衛生局特別指定幾家流感應變醫院，讓病人需要住院的時候，可以明確的有可轉診的醫院來收治。』
石崇良指出，包括台北、桃園、台中、高雄等地的醫學中心急診都因流感而吃緊，近日就會指定各地區中度以上急救責任醫院為應變醫院，讓流感病患分流。石崇良：『(原音) 這部份我們會即刻啟動，指定一些醫院，開始清出一些病床，調度加護病房來收治需要住院的病患。』
另外，有關加護病床使用方面，石崇良說，未來衛生署會更明確釐清可使用的空床量，並由政府出面協調調度，以避免第一線醫療人員在面臨臨床診治壓力的同時，還要擔負調度病床的行政負荷。