行政院發布新聞稿，為關切0206震災對台南市文化資產損壞情形，張善政上午勘查市定古蹟「風神廟」鐘樓及鼓樓受損情形、及實地了解國定古蹟「祀典武廟」廟體內外部的受損狀況外，並參拜祈福祈願國泰民安。
張善政表示，無論是需要優先處理的結構性修復，或需較長作業時間的細緻性修復，都需大家共同努力，希望能趁機補強並恢復地震前原本的樣貌。而在維修經費方面，無論是市定古蹟或是國定古蹟，中央都會支持。
隨後，張善政陪同總統馬英九出席0206台南震災罹難者聯合祭奠暨追思會，向所有罹難者默哀，表達最深的哀悼與追思，並向家屬慰問致意，期盼在政府及各界的努力與協助下，罹難同胞家屬及受災民眾早日重建家園走出陰霾。
據文化部表示，這次地震造成嘉義縣（市）、台南市及高雄市等4地方政府計有12處國定古蹟、32處直轄市及縣(市)定古蹟、7處歷史建築、1處聚落，共52處損壞，估計復原所需總經費約新台幣4億4800萬餘元，其中受災最嚴重的台南市約需經費2億7400萬餘元。
文化部說明，其中直轄市定古蹟「風神廟」受損，包括廟前「鐘樓」倒塌、石質構件斷裂四散、「鼓樓」四根石柱有三根出現環狀裂痕、風神廟內壁體發現多處裂縫，及木構件損壞錯位等情形。由於「鼓樓」四根石柱有三根出現環狀裂痕，有倒塌疑慮，已進行緊急加固，全面修復所需經費約5000萬元。
另外在國定古蹟「祀典武廟」災損方面，則包括正殿虎邊背牆「水月」門旁出現裂縫、正殿龍邊上方屋脊有垂直裂縫、正殿與前方過水廊交接處木柱位移傾斜、三川殿虎邊南側規帶掉落等，經結構技師提出結構初步評估後，已施作緊急加固措施，概估修復經費約4000萬元。1050227