金廈小三通船票價過高，加上金門水頭到五通航線旅程短與船齡老舊影響，金門地區民眾要求調降票價聲音不斷。金門縣長陳福海2014年就任以來特別重視，指示觀光處積極與交通部航港局與廈門方努力溝通。
2015年1月，交通部航港局長祁文中拜會縣府時，縣府提案建請小三通票價通盤檢討調降；9月，交通部召開全國交通首長會議，陳福海更指示當時的觀光處長王中聖代表出席，並再次提案促請交通部正視並研議小三通船運票價調降。
此外，小三通客運航線船票調整，因還涉及兩岸共同推動與配合票價研議，廈門港口管理局局長吳順彬去年8月來金交流時，陳福海特別針對此事與他交換意見，吳順彬當場允諾願意帶回協調可行方案。
小三通2015年創歷史新高176萬人次，縣府表示，為了更積極推動金門觀光旅遊，增進年節與淡季客源，陳福海今年1月26日更率觀光處長李增財等人專程到廈門拜會廈門港口管理局，在去年吳順彬來金承諾的基礎下，研究小三通票價優惠的可行方案。
縣府表示，經過雙方研討獲得共識，計劃將原票價新台幣650元（人民幣125元），從今年3月1日起實施金廈籍居民優惠方案為新台幣500元（人民幣100元），期盼帶動兩岸旅客互動，往來更頻繁。
縣府說，陳福海除了到廈門爭取到金廈小三通船票金門籍與廈門籍票價優惠方案外，年前再率縣府觀光處人員赴台北拜會交通部長陳建宇爭取支持小三通政策，同時提出票價調降、增加航班、船舶汰舊換新議題；陳建宇善意回應說，航港局會全力配合縣府。
由於本國籍船舶優惠金門籍由來已久，為了配合廈門方推動金廈小三通船票金門籍與廈門籍票價優惠方案，縣府最近再責成港務處2月邀集本國籍航商，就「金廈小三通推動優惠票價」座談，與會航商表示除提供原金門籍優惠外，願意配合跟進，擴大到廈門籍旅客共同實施優惠。