針對民進黨總統當選人蔡英文，日前指高教藍圖計畫在520前核定，是對新政府不尊重。行政院發言人孫立群今（25）日不滿的表示，新政府對事情不了解，就說不尊重，很多時侯「我們覺得非常不被尊重」。
對於高教藍圖計畫，教育部24日已承諾立法院教育委員，在教育委員會未通過前，5年千億計畫將會暫緩，不會送行政院核定。
孫立群指出，教育部推動的頂尖大學等3個方案，都將在今年底結束，行政院將這些方案預算，合在一起包成5年千億計畫，並在行政院在交接重要政策推動方式中，將「高教藍圖計畫」列為持續推動，並加強與各界溝通的法案。
不過，孫立群表示，5年千億計畫牽涉預算，送立法院審議的時間是在7月，而非520之前；孫立群說，對整個事情沒有了解，就說不尊重，「我們覺得非常不被尊重」。