水利局表示，水質改善將建置「水質淨化現地處理系統」，抽引上游遭污染支流排水並截流家庭污水淨化，避免污染物排入梧棲大排，並規劃於沙鹿火車站後站停車場旁建置水質淨化設施，每日可處理水量約7000公噸，淨化後的水將導流回梧棲大排做為大排生態基流量。
此外，水質淨化工程除具有污水淨化成效，將與當地景觀生態結合，設置放流水景觀池等設施，讓民眾深入瞭解處理成效，同時改善周遭環境景觀及生活環境品質，提升區域整體發展，縮短城鄉差距。
水利局指出，本計畫總經費約新台幣9700萬元，其中行政院環保署補助55%經費，市府則自籌配合款45%。